La Universidad Isaac Newton es propiedad de la Fundación Universitas, es presidida actualmente por el Lic. Greivin Arrieta López, quien ostenta total representación de la entidad en el plano jurídico-contractual. Su Rectora es la M.Sc. Laura Prendas Castillo

Autorización oficial: Originalmente funcionó como Colegio Isaac Newton, afiliado a la Universidad Autónoma de Centroamérica desde 23 de enero de 1985 (Acta N° 50-85 del CONESUP,) de la cual se independizó el 21 de diciembre de 1995 (Acta N° 288-95 de CONESUP).